Analizaré datos de microbioma y metagenómica 16s shotgun en r y python.

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Bioinformático

Hola a todos, soy Hazrat Maghaz, estudiante de la Escuela Interdisciplinaria de Ciencia e Ingeniería (SINES) de la NUST Pakistán. Tengo experiencia en bioinformática, genómica, secuenciación de próxim...

Nivel 1

Ha cumplido determinados criterios de rendimiento y muestra un gran potencial en la plataforma.

Acerca de este Servicio

Desbloquea el poder de los conocimientos microbianos con análisis experto de metagenómica


¡Bienvenido! Soy un investigador en bioinformática capacitado con experiencia práctica en metagenómica avanzada, perfilado de microbiomas y análisis de datos genómicos. Me especializo en extraer conocimientos profundos de datos de secuenciación complejos, ya sea de proyectos de 16S, ITS, 18S rRNA o metagenómica shotgun.

Mis soluciones de bioinformática son ideales para:

  • Investigadores académicos
  • Empresas de biotecnología
  • Estudios de microbioma ambiental
  • Proyectos de microbioma intestinal humano/animal

Servicios que ofrezco:

  • Preprocesamiento de datos en crudo: recorte, filtrado, descontaminación (FastQC, Trimmomatic, BBMap)
  • Montaje y anotación de metagenomas (MEGAHIT, SPAdes, Prokka, EggNOG)
  • Perfilado taxonómico (Kraken2, Bracken, QIIME2)
  • Análisis funcional (HUMAnN3, LEfSe, PICRUSt2)
  • Métricas de diversidad (Alfa, Beta; PCoA, NMDS)
  • Descubrimiento de biomarcadores y análisis de abundancia diferencial
  • Visualización personalizada (R, Python, ggplot2, Krona, mapas de calor)
  • Informes científicos detallados con interpretación


Tecnologías y herramientas: QIIME2, HUMAnN, Kraken2, Bowtie2, MEGAHIT, LEfSe, R, Python, Linux, Galaxy, BBMap, EggNOG, Prokka


Vamos a decodificar tus datos y convertir secuencias en ciencia.

Tecnología:

Excel

Hojas de cálculo de Google

Jupyter Notebook

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis estadístico

Experiencia:

Diseño de experimentos

Tendencias

Algoritmos

Lenguaje de programación:

Python

R

SQL

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