Analizaré los resultados de knockout virtual de genes con sctenifoldknk

Analizo las salidas existentes de scTenifoldKnk y organizo los resultados de knockout virtual alrededor de tu gen objetivo y tipo de célula.

El paquete Básico cubre un objetivo y un tipo de célula usando tus archivos de respuesta o red existentes. Verifico identificadores, resumo los resultados de regulación diferencial y creo gráficos claros y tablas editables. Las comparaciones entre semillas proporcionadas pueden incluirse cuando se acuerde antes de realizar el pedido.

Recibes tablas de resultados, figuras, el script de análisis y un README que registra los inputs y ajustes. Se incluye una revisión para el análisis acordado.

Por favor, envía tu gen objetivo, las etiquetas de tipo de célula, archivos de salida existentes y la pregunta que quieres responder. Para enriquecimiento, proporciona los genes evaluados y la lista de genes de fondo.

Si solo cuentas con un acceso GEO o un objeto Seurat, escríbeme primero: la construcción de la red y el procesamiento de datos brutos requieren un alcance separado. Uso codificación asistida por IA cuando corresponde y verifico el código y los resultados. La comunicación escrita es bienvenida.