Analizaré trayectorias de dinámica molecular y contactos proteína ligando

Analizo trayectorias existentes de dinámica molecular y devuelvo figuras claras y los datos numéricos que las respaldan.

El paquete Básico cubre un sistema proporcionado de hasta 100 ns: comprobaciones de archivos coincidentes, RMSD de proteína y ligando, RMSF de residuos, tablas CSV editables, figuras, scripts de análisis y un README que registra selecciones, referencia y ventana temporal.

Por favor proporciona las trayectorias coincidentes, archivos de topología y estructura, una descripción del sistema y tu pregunta de investigación. La persistencia de contacto, distancias de bolsillos y comparaciones entre múltiples sistemas se planifican por separado.

Para una simulación nueva de proteína con molécula pequeña, envía la proteína o ID de gen, especie y nombre del compuesto o SMILES. La preparación de la estructura, selección de parámetros, un piloto de 10 ns y ejecuciones en la nube más largas pueden cotizarse por separado tras revisar el sistema y las necesidades de cómputo.

Escribe antes de encargar para confirmar la compatibilidad de archivos y el alcance. La comunicación escrita es bienvenida. Utilizo codificación asistida por IA y verifico el código y los resultados; dime tus restricciones de manejo de datos antes de compartir archivos.