Haré análisis y visualización de datos de transcriptómica con r o python

Ofrezco análisis de datos de transcriptómica que incluyen análisis de expresión RNA-seq, pruebas estadísticas, visualización (PCA, mapas de calor, gráficos de volcán) y modelado básico de aprendizaje automático para clasificación e interpretación biológica usando R o Python.

El análisis de transcriptómica incluye:

• Procesamiento de datos RNA-seq (conteos / matriz de expresión)
• Análisis de expresión diferencial (estadísticas básicas: t-test, comparaciones estilo DE si se proporcionan datos)
• Normalización de datos (escalado básico / transformación logarítmica)
• Análisis exploratorio:
• Gráficos PCA
• Mapas de calor
• Gráficos estilo volcán (si existen resultados DE)
• Comparación de grupos (control vs enfermedad, etc.)

El análisis estadístico incluye:

• Media, varianza, cambio de pliegue
• Comparaciones de grupos (t-test / pruebas estadísticas básicas)
• Análisis de correlación
• Interpretación básica de resultados

Aprendizaje automático :

• Modelos básicos de clasificación:
• Regresión logística
• Bosque aleatorio
• Selección de características
• Evaluación del modelo:
• Precisión, matriz de confusión
• Curva ROC

Todos los paquetes incluyen scripts de código reproducibles (R/Python) para que puedas reproducir y validar completamente el análisis

También se aceptan pedidos personalizados según conjuntos de datos específicos, requisitos de análisis y objetivos de investigación