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Realizaré análisis de expresión génica diferencial en rnaseq usando edger o deseq
Analista de bioinformática y escritora científica para datos de RNA Seq y NGS
Soy estudiante de MS en Bioinformática en NUST con una licenciatura en Optometría. Tengo experiencia práctica en análisis de datos de secuenciación de próxima generación (NGS). Mis habilidades incluye...
Acerca de este Servicio
¿Buscas un análisis profesional de expresión génica diferencial en RNA-Seq?
Realizaré un análisis completo de DGE en tus datos de matriz de conteo usando edgeR o DESeq2 en R.
Lo que obtendrás:
- Control de calidad (gráfico PCA y mapa de calor)
- Detección y eliminación de valores atípicos
- Normalización TMM
- Análisis de expresión diferencial
- Gráfico de volcán con genes significativos destacados
- Archivo CSV con resultados completos
- Resumen de genes regulados y no regulados
Tengo experiencia práctica analizando grandes conjuntos de datos de RNA-Seq con cientos de muestras usando pipelines de edgeR y DESeq2 en R.
¡Por favor, envíame un mensaje antes de ordenar para discutir tus datos y requisitos!
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Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿En qué formato deben estar mis datos?
Necesito una matriz de conteo en bruto en formato .txt o .csv y un archivo de metadatos con la información del grupo de muestras.
¿Qué herramienta usas, edgeR o DESeq2?
Puedo usar cualquiera de las dos, edgeR o DESeq2, dependiendo de tu preferencia. Ambas ofrecen resultados confiables para análisis de expresión génica diferencial en RNA-Seq.
¿Qué recibiré después del análisis?
Recibirás figuras de alta resolución que incluyen gráfico PCA, mapa de calor y gráfico de volcán, un archivo CSV con todos los resultados y un resumen de los genes diferencialmente expresados.
