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Realizaré simulaciones de acoplamiento molecular y dinámica
Dr. Zainab K.
Level 2
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Acerca de este Servicio
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En The Freelance Bubble ofrecemos simulaciones de acoplamiento molecular y MD de nivel experto para apoyar tus proyectos de descubrimiento de fármacos. Desde la selección de ligandos hasta el análisis de estabilidad de unión, entregamos resultados reproducibles y listos para publicación.
- Docking Starter: Acoplamiento de 1-2 ligandos con la proteína objetivo + visualización de afinidad de unión y pose. Análisis ADMET.
- Binding Insight: De 5 a 10 ligandos, análisis de interacción, mapeo del sitio de unión y puntuaciones comparativas de docking. Análisis ADMET.
- Dynamic Discovery Suite: Acoplamiento completo + simulaciones de MD (hasta 100 ns) con gráficos de RMSD, RMSF, Rg y estabilidad de unión. (Consulta si necesitas más tiempo de simulación)
Herramientas y recursos:
- Acoplamiento proteína-ligando (AutoDock, PyRx),
- Simulaciones de MD (GROMACS/AMBER),
- Análisis de interacción y estabilidad (RMSD, RMSF, Rg, SASA),
- Cálculos de energía y visualizaciones (PyMOL, Chimera).
- Análisis ADMET (SwissADME)
Incluye informes detallados, gráficos y scripts reproducibles (a solicitud).
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Conoce a Dr. Zainab K.
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble
Level 2
- DePakistán
- Miembro desdemay 2025
- Responde aprox. en:1 hora
- Última entrega1 mes
Idiomas
Inglés, Urdu, Punjabí
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I lead a team of 23+ PhD scholars dedicated to delivering high-quality academic and research support services, including Systematic Reviews, Meta-Analyses, Molecular Simulations, Bioinformatics, Data Analysis, and Scientific Writing.
Besides TFB, I am Biotechnologist turned Bioinformatician, I specialize in in-silico vaccine design, drug repurposing, and coding pipelines. We also organize workshops and training programs to advance research and computational expertise.
We also help start-ups in brandings and visuals.
Own a clothing brand, NayeeReet.
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Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos de entrada necesitas de mí?
Por lo general, necesito la estructura de tu proteína (formato PDB) y ligandos en formato MOL2/SDF/PDBQT. Si no los tienes, puedo ayudarte a prepararlos.
¿Qué software utilizas?
Utilizo AutoDock Vina, PyRx para docking y GROMACS (o AMBER a solicitud) para simulaciones MD. Las visualizaciones se crean con PyMOL, Chimera o VMD.
¿Puedes realizar simulaciones para cualquier proteína?
Sí, siempre que exista una estructura 3D válida (PDB o modelo por homología), puedo realizar docking y simulaciones MD para ella.
¿Recibiré un informe?
Sí. Cada paquete incluye un informe PDF detallado con métodos, resultados, gráficos (por ejemplo, RMSD, RMSF) y visuales de unión. Los paquetes premium también incluyen archivos de entrada/salida y scripts.
¿Son estos resultados adecuados para publicación o trabajo de tesis?
Por supuesto. Sigo flujos de trabajo de nivel investigativo y proporciono visuales y datos listos para publicación.
¿Mis datos se mantienen confidenciales?
Sí. Tus datos son completamente confidenciales y no serán compartidos ni reutilizados bajo ninguna circunstancia.
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A amohseni298_
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Dr. Zainab has been a true professional, very knowledgeable, a pleasure to work with. She is honest and straight forward lady. the quality of her work is outstanding. She offers valuable professional advise to her clients. I am truly satisfy with her work and i would recommend her to my colleagues
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Útil?A audreylee04
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Very professional! I am happy with the service. :)
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Delivered on time with all the requested details. A good freelancer.
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