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Realizaré análisis diferencial de RNA-seq y transcriptómica
Cofundador de The Freelance Bubble LLC
Como cofundador de The Freelance Bubble, trabajo con un equipo multidisciplinario de más de 23 académicos con doctorado, brindando soporte técnico y de investigación de alta calidad. Soy biotecnólogo ...
Nivel 2
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Acerca de este Servicio
En The Freelance Bubble, ofrecemos análisis profesional de RNA-seq y transcriptómica para investigadores, laboratorios, equipos académicos y proyectos biotecnológicos que buscan resultados confiables, reproducibles y listos para publicación.
Nuestro equipo multidisciplinario aporta experiencia en bioinformática, genómica, biología molecular, estadística e investigación científica para apoyar proyectos desde la planificación del estudio hasta la interpretación biológica.
Nuestros servicios incluyen:
- Consulta y revisión de proyectos de RNA-seq
- Control de calidad y preprocesamiento
- Normalización de conteos
- Análisis de expresión diferencial de genes
- PCA y agrupamiento de muestras
- Heatmaps y gráficos de volcán
- Anotación de genes
- Análisis de enriquecimiento GO y de vías
- Interpretación funcional de genes significativos
- Figuras y tablas listas para publicación
- Scripts en R/Python y flujos de trabajo reproducibles
- Revisión de resultados y soporte en presentaciones
Trabajamos con R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook y herramientas relacionadas de bioinformática.
Contáctanos antes de ordenar para procesamiento de FASTQ en crudo, alineación, RNA-seq de célula única, cohortes grandes o pipelines personalizados.
Dominio:
Aprendizaje automático
•
Otros
Lenguaje de programación:
Python
•
R
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SQL
•
Colab
•
Otros
Tecnología:
Python
•
R
•
Jupyter Notebook
•
Pandas
•
RStudio
•
Otros
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué tipos de proyectos de RNA-seq apoyas?
Apoyamos proyectos de RNA-seq en masa y transcriptómica que involucran expresión diferencial de genes, análisis de vías, enriquecimiento funcional, agrupamiento, visualización e interpretación biológica.
¿Puedes analizar archivos FASTQ en crudo?
Sí, el procesamiento de FASTQ en crudo puede ser soportado como un flujo de trabajo personalizado. Por favor, contáctanos antes de ordenar porque alineación, cuantificación y conjuntos de datos grandes pueden requerir alcance adicional.
¿Qué herramientas usas?
Dependiendo del proyecto, usamos R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook y otras herramientas de bioinformática apropiadas.
¿Realizan análisis de expresión diferencial de genes?
Sí. Podemos realizar normalización, pruebas de expresión diferencial, análisis de cambio de pliegue, filtrado por significancia y visualización.
¿Puedes proporcionar PCA, heatmaps y gráficos de volcán?
Sí. Ofrecemos visualizaciones profesionales como gráficos PCA, agrupamientos, heatmaps, gráficos de volcán y otras figuras relevantes.
¿Realizan análisis de vías y enriquecimiento?
Sí. El enriquecimiento funcional, la ontología de genes y el análisis de vías pueden incluirse según el paquete seleccionado.
¿Recibiré el código fuente?
Sí. Se pueden proporcionar scripts/notebooks reproducibles en R o Python según el alcance del proyecto.
¿Puedes ayudar a interpretar los resultados biológicos?
Sí. Podemos ayudar a interpretar genes significativos, vías enriquecidas, patrones de expresión y su relevancia para tu pregunta de investigación.
¿Ofrecen consulta además del análisis?
Sí. En The Freelance Bubble ofrecemos tanto consulta experta como análisis práctico de transcriptómica, dependiendo del paquete que elijas.
¿Debo comunicarme con usted antes de realizar el pedido?
Sí, especialmente para archivos FASTQ en crudo, RNA-seq de célula única, cohortes grandes, transcriptómica de novo, pipelines personalizados o diseños experimentales complejos.
