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Realizaré análisis de expresión diferencial de secuenciación de rna microbiana usando deseq2 y snakemake
Investigador en Biotecnología: Genómica Microbiana y Bioinformática
Investigador en Biotecnología y Microbiología con más de 4 años de experiencia en genómica computacional.
Mi trabajo está publicado en revistas revisadas por pares (consulta mi sección de 'Certifica...
Acerca de este Servicio
¡Bienvenido! Como Investigador con doctorado en Biotecnología y Microbiología, ofrezco análisis experto para datos de RNA-Seq microbial.
No solo ejecuto código; soy un investigador publicado que comprende la ciencia detrás de tus resultados. Mi especialidad es expresión diferencial de genes (DGE) e identificar los genes clave que se regulan hacia arriba o abajo en tu estudio.
### Qué ofrece este gig (RNA-Seq DGE)
Ofrezco tres niveles de análisis basados en mi pipeline comprobado (FastQC, HISAT2, featureCounts, DESeq2). (Consulta mi FAQ abajo sobre el conteo de muestras).
* Básico (El "Datos"):
Ejecutaré todo el pipeline hasta Read Counts (Paso 04). Este paquete es ideal para investigadores que usan R/Python y solo necesitan la Matriz de conteos final.
* Estándar (El "Análisis"):
Este es el análisis completo de DGE (Paso 05). Incluye todo en Básico, MÁS todas las visualizaciones clave: Volcano Plot, PCA Plot y Heatmap.
* Premium (La "Perspectiva PhD"):
El paquete completo listo para publicación. Incluye todo en Estándar, MÁS: un informe PDF completo con mi Interpretación Biológica experta (el "por qué") y el Jupyter Notebook reproducible usado en tu análisis.
**Por favor, contacta conmigo antes de ordenar para discutir tu proyecto.
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Lenguaje de programación:
Python
•
R
•
SPSS
Tecnología:
Jupyter Notebook
Experiencia:
Análisis de clústeres
Herramientas:
Pandas
Otros servicios de Análisis de datos que ofrezco
FAQ
Traducción automática
¿Los precios de tus paquetes mencionan el número de muestras? ¿Por qué?
Los precios ($30, $50, $80) son una base para proyectos piloto pequeños (por ejemplo, 1-3 muestras). Para cohortes mayores (4, 6 o más de 20 muestras), envíame un mensaje. Discutiremos tus objetivos y te enviaré una oferta personalizada precisa.
¿Por qué debería elegir el paquete Premium? ¿Cuál es su valor?
El paquete Premium es mi servicio de nivel PhD "Insight". No solo proporciono una lista de genes; ofrezco un informe PDF completo con <strong>Interpretación Biológica</strong> (el "<strong>por qué</strong>"). También obtienes el <strong>script reproducible de Jupyter</strong> para tu publicación.
¿Qué necesitas de mí para empezar?
Necesito 3 cosas: 1. Tus archivos FASTQ en crudo (R1 y R2). 2. El genoma de referencia (FASTA) y los archivos de anotación (GFF/GTF). 3. Tu archivo de metadatos (por ejemplo, qué muestras son 'Control' vs 'Tratado').
