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Analizaré datos de rnaseq desde lecturas crudas hasta enriquecimiento funcional
Bioinformático e investigador de doctorado
¡Hola! Tengo un MSc en Bioinformática y actualmente soy estudiante de doctorado e investigador dedicado a genómica y biología molecular. Tengo amplia experiencia manejando datos biológicos a gran esca...
Acerca de este Servicio
¡Bienvenido a mi Gig de Bioinformática y RNA-Seq!
¿Necesitas un análisis riguroso, listo para publicación, para tus datos de Illumina RNA-Seq? Como MSc en Bioinformática y estudiante de doctorado, ofrezco procesamiento completo adaptado a tu investigación. Transformo archivos FASTQ crudos o matrices de conteo en resultados claros y reproducibles.
Lo que ofrezco:
- Control de calidad: FastQC y recorte de lecturas.
- Alineamiento: Mapeo preciso al genoma de referencia.
- Expresión diferencial (DEGs): Análisis estadístico usando DESeq2.
- Enriquecimiento funcional: Vías GO y KEGG mediante clusterProfiler.
- Gráficos listos para publicación: Mapas de calor de alta resolución, gráficos de volcán, PCA y redes.
Herramientas: R, Python y paquetes de Bioconductor.
⭐ ¿Por qué elegirme?
- Rigor académico: Investigador activo desarrollando pipelines confiables.
- Reproducibilidad: Scripts limpios listos para tu sección de métodos.
- Enfoque biológico: Dedicado a tu pregunta de investigación específica.
️ IMPORTANTE: Por favor, envíame un mensaje ANTES de hacer tu pedido. Necesitamos discutir tu diseño experimental y tamaño de muestra para garantizar la mejor oferta personalizada. ¡Vamos a publicar tu artículo!
FAQ
Traducción automática
¿Qué tipo de archivos necesito proporcionar para comenzar el pedido?
Depende del paquete que elijas. Para el paquete básico, necesito tus lecturas de secuenciación crudas (archivos FASTQ). Para los paquetes estándar y premium, si ya realizaste el alineamiento, puedes proporcionar la matriz de conteo cruda (.csv, .tsv o .txt).
¿Cuántas muestras están incluidas en el precio base?
Los precios base de todos los paquetes cubren análisis de hasta 6 muestras (por ejemplo, 3 muestras de control vs. 3 muestras de tratamiento). Si tu diseño experimental incluye más muestras, por favor envíame un mensaje para una oferta personalizada, ya que el tiempo de procesamiento aumentará.
¿Puedes analizar datos de organismos no modelo?
¡Sí! Siempre que exista un genoma de referencia anotado y un archivo GTF/GFF disponible en bases de datos públicas (como NCBI o Ensembl), puedo realizar el análisis. Por favor, contáctame antes de ordenar para verificar la disponibilidad del genoma de referencia para tu organismo.
¿Recibiré los scripts utilizados para mi análisis?
¡Sí! Si eliges el paquete premium, te proporcionaré los scripts limpios y bien comentados en R o Python utilizados para generar tus resultados. Esto garantiza total transparencia y reproducibilidad, facilitando que puedas redactar tu sección de metodología.
¿Qué pasa si necesito un gráfico muy específico o altamente personalizado para mi artículo?
Los paquetes estándar y premium ya incluyen gráficos de alta calidad y estándar (como PCA, Volcano y mapas de calor). Sin embargo, si necesitas una figura muy específica o personalizada (como redes de interacción complejas o temas personalizados específicos), puedes agregar la opción "Gráfico personalizado extra".
¿Cómo te envío mis archivos de datos grandes (FASTQ)?
Fiverr tiene un límite de tamaño de archivo para cargas directas. Para archivos de secuenciación grandes, puedes compartir un enlace seguro vía Google Drive, Dropbox, OneDrive o directamente desde servidores/repositorios de secuenciación (como SRA/ENA), y los descargaré de forma segura.
