Analizaré datos de scrna seq, transcriptómica espacial y ngs

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Estudiante de doctorado

Soy investigador especializado en análisis de datos de NGS. Tras analizar datos para mis propias publicaciones y las de otros revisadas por pares, sé exactamente qué se necesita para entregar resultad...
Acerca de este Servicio

Obtén análisis de datos NGS de calidad para publicación de un bioinformático experimentado

Me especializo en análisis de datos de Next-Generation Sequencing (NGS), con experiencia práctica entregando resultados para publicaciones revisadas por pares. Transformo datos de secuenciación en conocimientos biológicos claros y listos para publicar, respaldados por un sólido conocimiento en biología experimental.

Servicios que ofrezco:

  • Análisis de scRNA-Seq: Control de calidad del pipeline completo, reducción de dimensionalidad (PCA/UMAP), agrupamiento, anotación de tipos celulares e inferencia de trayectorias (Seurat/Bioconductor)
  • Transcriptómica espacial: Integración con datos de scRNA-seq, mapeo de expresión génica a la morfología del tejido, identificación espacial de genes
  • RNA-Seq en masa: FastQC, alineación, análisis de expresión diferencial (DESeq2), enriquecimiento funcional (GO/KEGG)
  • Visualización de datos: Figuras de alta resolución, listas para publicación (heatmaps, volcano plots, gráficos personalizados en ggplot2/ComplexHeatmap)

Herramientas y tecnologías:

Lenguajes: R (Tidyverse, Bioconductor), Bash/Linux

Tipos de datos: FASTQ, BAM, VCF, matrices de conteo

Por qué trabajar conmigo:

Métodos basados en la literatura actual y rigor académico

Código limpio y reproducible con informes de análisis detallados

Comunicación clara y rápida entrega

Tecnología:

Excel

Jupyter Notebook

Pandas

RStudio

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis cualitativo

Experiencia:

Diseño de experimentos

Análisis de clústeres

Lenguaje de programación:

Python

R

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