Haré modelado por homología, acoplamiento molecular y simulaciones de MD.

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Bioinformática estructural

Estudiante de doctorado especializado en bioinformática estructural y descubrimiento de fármacos impulsado por IA. Puedo ofrecer soluciones de investigación listas para publicación usando protocolos e...
Acerca de este Servicio

Acelera tu investigación con servicios profesionales de descubrimiento de fármacos computacional. Como estudiante de doctorado en Bioinformática Estructural, ofrezco simulaciones y análisis rigurosos, listos para publicación, adaptados a tus objetivos biológicos específicos.

Lo que ofrezco:

  1. Consulta: Discusión sobre posibles rutas para resolver tareas.
  2. Metodología detallada: Complejidades de entradas, métodos y herramientas.
  3. Modelado por homología: Predicción de estructura 3D de alta calidad (AlphaFold2/Modeller) con validación (Ramachandran, ERRAT, Verify3D).
  4. Acoplamiento molecular: Acoplamiento completo de proteína-ligando, proteína-proteína y proteína-ADN usando AutoDock Vina, MoleDock o HADDOCK.
  5. Simulaciones MD (GROMACS): Simulaciones avanzadas de complejos. Ofrezco gráficos de RMSD, RMSF, radio de giro, estabilidad de enlaces de hidrógeno y SASA.
  6. Energía de unión: Cálculos precisos de afinidad usando métodos MMPBSA/GBSA.
  7. QSAR y ML: Modelos de aprendizaje automático para predecir actividad y toxicidad de compuestos.

¿Por qué trabajar conmigo? No solo ejecuto software; produzco soluciones para críticas complejas en bioinformática.

Recibirás:

  • Imágenes de visualización 3D de alta resolución.
  • Gráficos y tablas de datos de calidad para publicación.
  • Informes detallados de metodología para tus manuscritos.

Dominio:

Aprendizaje automático

Otros

Experiencia:

Análisis predictivo

Lenguaje de programación:

Python

Herramientas:

Jupyter Notebook

Excel

Otros

Tecnología:

Python

Colab

Excel

Otros

Modelos y métodos:

Aprendizaje automático