Procesaré y analizaré tus datos de genómica o vcf usando python
Desarrollador en Python Bioinformática Analista de Datos
Acerca de este Servicio
¿Tienes datos de genómica que necesitan procesamiento, filtrado o
anotación pero no sabes por dónde empezar?
Construiré una pipeline de bioinformática confiable para procesar tus
datos de VCF, BCF o GWAS usando herramientas estándar de la industria que entregan
resultados limpios, anotados y listos para análisis.
Lo que puedo hacer:
Procesamiento y conversión de formatos de archivos VCF/BCF
Filtrado de variantes por calidad, profundidad y frecuencia alélica
Anotación de SNP usando Ensembl VEP
Procesamiento de datos GWAS basado en PLINK
Estadísticas de QC y reportes resumidos con bcftools
Conversiones de formatos de archivos (VCF, BCF, PLINK, haps/muestras)
Automatización de workflows completos con Python
Visualización de datos de distribución de variantes y métricas de calidad
Lo que recibirás:
Archivos de salida procesados y filtrados
Informe resumido de QC
Script de pipeline en Python (limpio, comentado y reutilizable)
Documentación clara e instrucciones de uso
Trabajo con bcftools, tabix, PLINK, Ensembl VEP y Python
las mismas herramientas usadas en pipelines de investigación en GWAS y genómica en producción.
Escríbeme antes de ordenar para describir tu conjunto de datos y objetivos.

