Realizaré simulaciones de dinámica molecular, diseño de rutas, dft, qsar.

Te ayudaré con el descubrimiento de fármacos in silico usando herramientas estándar de la industria como GROMACS, ORCA, AutoDock, Schrödinger y cheminformatics basado en Python.

Este servicio incluye:

Docking molecular (proteína-ligando) usando Glide/MOE/AutoDock

Simulación MD en GROMACS y 100 ns de un complejo en solo ~6 horas (GROMACS hasta 5000 ns)

• RMSD
• RMSF
• SASA
• RG
• H-Bond
• DCCM
• PSA
• PCA
• DSSP
• FEL

Modelado QSAR

• 2D/3D
• Regresión IC50/pIC50
• Optimización de descriptores

Cálculos DFT:

• Brecha HOMO-LUMO, gráficos de orbitales, mapas ESP
• Optimización de geometría, frecuencias IR
• UV/Vis (TD-DFT), fluorescencia

Modelado de farmacóforos y cribado virtual

Cálculo de energía de unión

• MM-GBSA
• MM-PBSA

Visualización 3D/2D de interacciones de unión de proteína-ligando

Opcional:

• Método
• Sección de Resultados y Discusión para publicación/tesis

Recibirás:

• archivos .pdb/.xyz/.csv
• análisis escrito
• hojas de puntuación + gráficos
• imágenes de 300/500/600 dpi de interacciones

Ya seas estudiante de PhD/MS, investigador académico o científico de la industria, ofrezco resultados rápidos y precisos con visuales de calidad para publicación.

Antes de hacer tu pedido, envíame un mensaje para asegurar que tus objetivos y ligandos sean compatibles con las herramientas