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Realizaré llamada de variantes genómicas y anotación de genes usando gatk
Acerca de este Servicio
¿Tienes datos de secuencia genómica y necesitas ayuda con la identificación de variantes o la anotación de genes? Realizaré un análisis genómico claro, bien documentado y entregaré resultados que podrás usar directamente en tu investigación o tesis.
Lo que ofrezco:
- Control de calidad y recorte de secuencias de ADN (FastQC, Trimmomatic)
- Alineación al genoma de referencia (BWA, Bowtie2)
- Llamada de variantes SNP e indel (GATK, bcftools)
- Anotación y filtrado de variantes (SnpEff, ANNOVAR)
- Detección de genes y anotación funcional (Prokka, BLAST)
- Gráficos Manhattan, tablas resumen de variantes e informe escrito
Todos los scripts (Python/Bash/R) están incluidos para que tu análisis sea completamente reproducible. Trabajo con genomas humanos, de plantas y microbianos.
Envíame tus archivos FASTQ o VCF y detalles del organismo antes de hacer tu pedido.
FAQ
Traducción automática
¿Qué organismos soportas?
Genomas humanos, animales, plantas y microbianos siempre que exista un genoma de referencia.
¿Qué archivos de entrada necesitas?
Archivo FASTQ en crudo o un archivo BAM/VCF ya alineado. Puedo trabajar con cualquiera de los dos.
¿Recibiré los scripts utilizados?
Sí, se entrega todo el código para que puedas reproducir o ampliar el análisis tú mismo.
