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Haré análisis de bioinformática de rna seq, wgs, wes y ngs
Especialista en bioinformática y biología computacional
¿Necesitas análisis confiables de bioinformática o computacional para tu investigación?
Soy investigador en MS Bioinformática en NUST, trabajando en genómica, descubrimiento de fármacos computacional...
Acerca de este Servicio
¿Tienes datos de RNA-seq, NGS, WGS o WES pero necesitas un flujo de trabajo bioinformático claro y reproducible?
Ofrezco análisis de datos de bioinformática y genómica profesionales para investigadores, estudiantes y equipos de investigación, desde datos de secuenciación en bruto hasta interpretaciones biológicas significativas.
MIS SERVICIOS INCLUYEN
- Análisis de datos de RNA-seq y NGS
- Control de calidad y preprocesamiento de FASTQ
- Recorte y filtrado de lecturas
- Alineamiento y cuantificación
- Análisis de expresión génica
- Análisis de expresión diferencial
- PCA, mapas de calor y gráficos de volcán
- Análisis de datos de WGS y WES
- Detección, filtrado y anotación de variantes
- Análisis de transcriptómica
- Enriquecimiento GO y KEGG
- Análisis GSEA y de vías
- Análisis estadístico y visualización
- Conjuntos de datos públicos como GEO y TCGA
- Flujos de trabajo reproducibles en bioinformática
- Figuras y tablas de calidad para publicación
HERRAMIENTAS
Python | R | Linux | FastQC | MultiQC | STAR | HISAT2 | BWA | SAMtools | featureCounts | DESeq2 | GATK | bcftools y otras herramientas bioinformáticas específicas del proyecto.
Envíame tu objetivo de investigación y datos disponibles, y te ayudaré a determinar el flujo de trabajo de análisis adecuado.
FAQ
Traducción automática
¿Qué tipos de datos de secuenciación puedes analizar?
Puedo trabajar con conjuntos de datos de RNA-seq, WGS, WES y otros NGS. Dependiendo del proyecto, puedo comenzar desde archivos FASTQ en bruto, archivos BAM, matrices de conteo, archivos VCF o datos genómicos procesados.
¿Puedes comenzar desde archivos FASTQ en bruto?
Sí. Puedo comenzar desde archivos de secuenciación en bruto y realizar control de calidad, preprocesamiento, alineación o cuantificación y análisis downstream apropiados.
¿Realizas análisis de expresión diferencial en RNA-seq?
Sí. El flujo de trabajo puede incluir generación de conteos, normalización, expresión diferencial, PCA, mapas de calor, gráficos de volcán e interpretación biológica.
¿Realizas análisis de WGS y WES?
Sí. Dependiendo del proyecto, el análisis de WGS/WES puede incluir QC, alineación, procesamiento de BAM, detección de variantes, filtrado, procesamiento de VCF y anotación.
¿Puedes realizar enriquecimiento GO, KEGG y de vías?
Sí. El enriquecimiento funcional puede incluir GO, KEGG, GSEA u otros análisis de vías apropiados según el organismo y los identificadores de genes disponibles.
¿Qué herramientas usas?
Las herramientas se seleccionan según el conjunto de datos y el diseño del estudio. Las herramientas comunes incluyen FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, BWA, SAMtools, featureCounts, DESeq2, GATK y bcftools, junto con Python, R y Linux.
