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Analizaré tus datos de microbioma 16s usando qiime2 bioinformatics
Hola, me llamo Steven Criollo. Soy ingeniero en biotecnología con una maestría en bioinformática y bioestadística. Imparto clases de bioinformática y también trabajo como bioinformático en una empresa...
Acerca de este Servicio
Tipos de análisis:
Análisis BÁSICO:
- Control de calidad de datos.
- Eliminación de ruido y agrupamiento (ASV).
- Clasificación taxonómica.
- Abundancia relativa.
- Árbol filogenético.
Análisis ESTÁNDAR:
Análisis básico +
- Curvas de rarefacción.
- Análisis de diversidad alfa: índice de Shannon, características observadas, diversidad filogenética de Faith, equitatividad de Pielou.
- Análisis de diversidad beta: distancia de Jaccard, distancia de Bray-Curtis, distancia de UniFrac no ponderada, distancia de UniFrac ponderada.
- Métodos de ordenación: Análisis de coordenadas principales (PCoA), Aproximación de Manifold uniforme y proyección (UMAP).
- Prueba de abundancia diferencial con ANCOM-BC.
- Pruebas de significancia estadística: Kruskal-Wallis, PERMANOVA (ADONIS), ANOSIM, PERMDISP.
Análisis PREMIUM:
Análisis estándar +
- Reacciones enzimáticas (EC).
- Genes (KO / Orthología KEGG).
- Vías metabólicas (MetaCyc).
- Análisis comparativo.
Notas:
*Los paquetes Estándar y Premium requieren información del grupo experimental y al menos 3 réplicas biológicas por grupo para realizar análisis de diversidad y estadísticos.
*El precio listado es por muestra. Hay descuentos disponibles para proyectos con múltiples muestras.
FAQ
Traducción automática
¿Cómo recibiré mis resultados?
Tus resultados se entregan a través de un enlace de almacenamiento en la nube que contiene todos los archivos generados durante el análisis, incluyendo archivos de QIIME2 (.qza/.qzv), figuras listas para publicación, tablas y un informe en HTML con una explicación paso a paso del análisis y una presentación clara y fácil de entender de todos los resultados.
