Seré tu experto consultor en bioinformática para tu investigación

Para acoplamiento: la estructura de tu proteína y el ligando (PDB, SDF...). Para MD: el sistema que quieres simular y los parámetros de simulación que necesitas (forcefield, duración, ensemble). Para transcriptómica: tu matriz de conteo o números de acceso GEO y el diseño experimental. Me encargaré del resto.

¡Por supuesto! Tengo acceso a infraestructura de GPU de alto rendimiento para simulaciones que requieren mucho cálculo. Sistemas grandes, tiempos largos y complejos de múltiples cadenas son totalmente manejables — habla de tu tamaño de sistema antes de ordenar para que podamos acordar tiempos de entrega realistas.

Sí, puedo configurar simulaciones MD según tus necesidades, hasta más de 500 ns. Las simulaciones más largas pueden requerir más tiempo y recursos, lo cual podemos discutir con anticipación.

¡Claro! Ofrezco análisis detallados post-simulación y salidas gráficas para respaldar tus objetivos de investigación.

Sí. Trabajo con datos de RNA-seq y microarrays — análisis de expresión diferencial (DESeq2, edgeR, limma-voom); WGCNA; enriquecimiento de ontología génica y vías; e infiltración inmunitaria. Si tienes conteos en crudo, matrices normalizadas o números de acceso GEO, puedo trabajar con cualquiera de ellos.

Sí. Uso pipelines de machine learning de consenso combinando Random Forest, regresión LASSO y SVM-RFE para identificar y clasificar candidatos a biomarcadores, seguido de validación en diferentes cohortes cuando los conjuntos de datos están disponibles. Los resultados incluyen gráficos de importancia de características y curvas ROC aptas para publicación.

¡Sí! Me especializo en figuras de alta resolución y listas para publicación, además de ilustraciones científicas adaptadas a las guías de las revistas. Conozco BioRender, herramientas de Adobe y Canva. Produzco figuras en formatos adecuados para envío a revistas.

Dependiendo de la complejidad y mi agenda, ofrezco opciones de entrega rápida por un costo adicional. Por favor, envíame un mensaje antes de ordenar si tienes una fecha límite estricta.

100% sí. Mantengo total confidencialidad. No comparto datos de clientes ni detalles del proyecto, y puedo firmar un NDA si tu trabajo lo requiere.

¡Por supuesto! Puedo explicar los resultados y el flujo de trabajo en un lenguaje sencillo, para que sea comprensible. Si eres investigador de laboratorio o estudiante nuevo en el lado computacional, puedo ajustar el nivel de explicación según sea necesario.