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Realizaré análisis de expresión diferencial y enriquecimiento en R
Análisis de datos de bioinformática y secuenciación
Soy estudiante de doctorado en Informática Médica con experiencia en Medicina Clínica e investigación en bioinformática. Procesos datos de RNA-seq bulk, datos de FASTQ de célula única usando Cell Rang...
Acerca de este Servicio
Análisis bioinformático downstream profesional de datos y visualización de calidad para publicación en R.
Procesos matrices crudas de conteo de expresión génica, tablas de microarrays o listas DEG ya calculadas para realizar pruebas estadísticas rigurosas y crear figuras aptas para publicación en revistas de alto impacto.
Paquetes y precios: - Básico (10 $ / 2 días): 1 análisis de DEG por contraste (DESeq2/limma/edgeR). Incluye diagrama de volcanos (EnhancedVolcano), diagrama PCA de muestras, mapa de calor de los DEG principales (pheatmap), tablas resumen y script reproducible en R. - Estándar (20 $ / 4 días): 1 DEG por contraste + enriquecimiento funcional. Todos los entregables Básicos más análisis de enriquecimiento de GO (BP/MF/CC) y de vías KEGG a través de clusterProfiler. Incluye dotplots, barplots y cnetplots. - Premium (40 $ / 7 días): Hasta 2 contrasts de DEG + enriquecimiento GO, KEGG y GSEA. Figuras de publicación altamente personalizadas (PDF vectorial y PNG a 600 DPI) con paletas de colores, anotaciones de genes y script en R completamente comentado.
Requisitos de entrada: Matriz de conteo cruda o tabla de expresión normalizada con la hoja de metadatos de muestras correspondiente (agrupación y covariables).
Límites de alcance: Análisis downstream solamente; uso para investigación. Incluye entrega rápida y resumen en inglés claro.
FAQ
Traducción automática
¿Qué formato de datos necesito proporcionar?
Por favor, proporciona una matriz de conteos de expresión (conteos crudos para DESeq2 o expresión normalizada para limma) junto con un archivo de metadatos de muestras que especifique condiciones experimentales y réplicas biológicas. Se aceptan formatos CSV, TSV o Excel.
