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Realizaré análisis de DEG y pathway en bulk rnaseq
Bioinformática Genómica R Python ML y Escritura Científica
Soy Saad, especialista en bioinformática y biología computacional enfocado en genómica vegetal, anotación de genomas, RNA-seq, análisis de datos, R, Python y escritura científica. A través de Saad Gen...
Acerca de este Servicio
Bienvenido a mi GiG,
¿Buscas análisis de bulk RNA-seq precisos, reproducibles y listos para publicación?
Ofrezco análisis personalizados de datos transcriptómicos para investigadores, laboratorios y profesionales de biotecnología. Puedo trabajar con matrices de conteo en bruto o archivos FASTQ, dependiendo del paquete seleccionado.
Los servicios pueden incluir:
- Control de calidad de FASTQ e informes de MultiQC
- Recorte de lecturas, alineación o cuantificación de transcriptos
- Generación de conteos a nivel de gen
- Normalización, PCA y correlación de muestras
- Análisis de expresión diferencial
- Gráficos de volcán, gráficos MA y mapas de calor
- Enriquecimiento de Gene Ontology y pathway
- Figuras y tablas de resultados listos para publicación
- Scripts en R y un informe de interpretación claro
Utilizo herramientas establecidas como FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR y clusterProfiler en entorno Linux.
Por favor, contáctame antes de ordenar para archivos FASTQ en bruto, organismos no modelados, diseños complejos o más de 12 muestras. Los resultados dependen de la calidad de los datos y del diseño experimental.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Aceptas archivos FASTQ en bruto?
Sí. El procesamiento de FASTQ está incluido en el paquete Premium o puede proporcionarse mediante una oferta personalizada. Por favor, envía el número de muestras, tipo de secuenciación y tamaños aproximados de los archivos antes de ordenar.
¿Puedes analizar una matriz de conteo existente?
Sí. Por favor, proporciona la matriz de conteo en bruto, metadatos de las muestras y las comparaciones que deseas realizar.
¿Qué organismos puedes analizar?
Puedo analizar conjuntos de datos de plantas, microbianos, animales y humanos cuando están disponibles el genoma de referencia, transcriptoma y recursos de anotación adecuados.
¿Proporcionarás figuras listas para publicación?
Sí. Las figuras pueden entregarse en formato PNG, TIFF, PDF o SVG según el paquete seleccionado y los requisitos de publicación.
¿Proporcionarás el código de análisis?
Los scripts de análisis están incluidos en los paquetes Standard y Premium. También pueden añadirse al paquete Basic como extra.
¿Garantizas genes o pathways significativos?
No. Los resultados dependen de la calidad de las muestras, profundidad de secuenciación, variación biológica y diseño experimental. Ofrezco análisis transparentes sin manipular ni fabricar resultados.
