Realizaré simulaciones de dinámica molecular aceleradas por GPU usando gromacs y lammps

Te ayudaré a ejecutar, solucionar problemas y analizar simulaciones de dinámica molecular usando GROMACS o LAMMPS.

Ya sea que tu simulación esté fallando, sea demasiado lenta o necesites un análisis completo, puedo manejar todo el flujo de trabajo desde la configuración hasta los resultados.

Lo que ofrezco:

• Configuración de simulaciones (topología, caja, solvatación)
• Minimización de energía y equilbración
• Ejecutar MD de producción (acelerado por CPU/GPU)
• Corregir errores en scripts de GROMACS o LAMMPS
• Optimización del rendimiento (aceleración por GPU)
• Análisis de trayectoria incluyendo:
• RMSD
• RMSF
• PCA
• Gráficos de energía
• Visualización y generación de gráficos

Herramientas:

• GROMACS
• LAMMPS
• Python (scripts de análisis)
• VMD / herramientas de visualización

Por qué elegirme:

• Experiencia con sistemas complejos (polímeros, biomoléculas)
• Entrega rápida y confiable
• Comunicación clara y actualizaciones
• Por favor, contacta conmigo antes de hacer un pedido para discutir tu proyecto.