Realizaré pipelines de bioinformática para rnaseq y metagenómica
Transformando datos biológicos complejos en resultados claros y accionables
Acerca de este Servicio
Ya sea que necesites un flujo de trabajo personalizado de RNA-Seq, análisis de diversidad microbiana o un pipeline multi-ómico construido desde cero, diseño soluciones de bioinformática reproducibles y escalables adaptadas a tus datos. Con experiencia práctica en HPC y Linux, creo flujos de trabajo limpios y bien documentados para que puedas enfocarte en la ciencia, no en el código.
Lo que puedo hacer por ti: Desde lecturas crudas hasta resultados finales, manejo el control de calidad del pipeline completo, recorte, alineación, cuantificación, expresión diferencial y visualización. Para metagenómica, cubro perfilado taxonómico, diversidad alfa/beta y análisis de comunidades microbianas.
Herramientas y software: Trabajo con herramientas estándar de la industria como FastQC, Trimmomatic, HISAT2, DESeq2, STAR, QIIME2, Kraken2, Bash/Linux, SLURM y R, asegurando que tu pipeline sea potente y reproducible.
Por qué trabajar conmigo: Cada pipeline se entrega con documentación clara y un README para que tu equipo pueda mantenerlo y reutilizarlo. Los scripts están optimizados para clusters HPC, escalables a grandes conjuntos de datos y completamente reproducibles. Ya seas investigador académico, startup biotecnológica o laboratorio clínico, entrego resultados en los que puedes confiar y construir.
Tipo de servicio:
Análisis
Idioma:
Inglés
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Francés
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