Construiré un árbol filogenético y analizaré tus secuencias de genes AMR
Analista de bioinformática, especialista en AMR y filogenética
Acerca de este Servicio
¿Te cuesta visualizar las relaciones evolutivas de tus genes de resistencia antimicrobiana (AMR)? Soy estudiante de maestría en Bioquímica y Biología Molecular con experiencia práctica en diagnósticos moleculares en salud pública. Combino mi profundo conocimiento biológico con pipelines automatizados de bioinformática para ofrecerte análisis filogenéticos listos para publicación.
Lo que haré por ti:
- Recuperación automática de secuencias desde NCBI (o trabajar con tus archivos FASTA proporcionados).
- Alineamiento de múltiples secuencias usando Clustal Omega.
- Construcción del árbol filogenético (Neighbor-Joining) con 100 réplicas bootstrap.
- Un informe claro en PDF de una página interpretando el significado biológico (por ejemplo, evidencia de transferencia horizontal de genes o expansión clonal).
¿Por qué elegirme?
No solo hago clic en botones en el software. Escribo scripts en Python (Biopython) que garantizan que tu análisis sea reproducible y rápido. Mi experiencia en laboratorio en Pruebas de Susceptibilidad a Antibióticos (AST) y PCR significa que entiendo el contexto clínico de tus genes de resistencia, no solo el código.
Entregables:
- Una imagen del árbol en alta resolución.
- El archivo FASTA alineado.
- Un informe en PDF con toda la metodología e interpretación.
Lenguaje de programación:
Python
Tecnología:
Jupyter Notebook
Tipo de análisis:
análisis estadístico
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Análisis predictivo
Experiencia:
Algoritmos
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Estadísticas
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Análisis de clústeres
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Otros
Herramientas:
Jamovi
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Google Colab
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Microsoft excel

