Realizaré análisis de datos de ngs
Acerca de este Servicio
Ofrezco servicios profesionales de análisis de datos de NGS, especializándome en convertir datos de secuenciación en bruto (FASTQ) en resultados de variantes de alta calidad (VCF).
Realizaré un pipeline completo y confiable usando herramientas estándar de bioinformática.
Lo que haré:
- Control de calidad de FASTQ (FastQC, fastp)
- Alineación de secuencias usando BWA
- Procesamiento de BAM con SAMtools
- Llamado de variantes usando GATK
- Salida de VCF limpia y reproducible
Lo que recibirás:
- Archivos BAM procesados
- Archivo VCF final
- Resumen de los pasos realizados
️ Importante:
- Adecuado para conjuntos de datos de investigación y académicos
- Conjuntos de datos grandes pueden requerir tiempo o recursos adicionales
Si tienes requisitos específicos, no dudes en contactarme antes de hacer tu pedido.
Tecnología:
Jupyter Notebook
•
RStudio
Experiencia:
Predicción
Lenguaje de programación:
Python
•
R
•
SQL
FAQ
Traducción automática
¿Qué datos necesitas?
Archivos FASTQ y genoma de referencia (si está disponible)
¿Puede manejar grandes conjuntos de datos?
Sí, pero conjuntos de datos grandes pueden requerir tiempo o recursos adicionales.
¿Qué herramientas usas?
BWA, SAMtools, GATK, FastQC y fastp.
¿Proporcionarás interpretación?
La interpretación básica está incluida en el paquete premium.
