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Realizaré análisis de expresión diferencial de rnaseq con deseq2 o edger
Analizaré tus datos de proteómica LC MSMS y entregaré resultados para publicación
Investigador universitario especializado en proteómica LC-MS/MS, transcriptómica e integración multi-ómica. Publico en revistas como Scientific Reports (Nature) y trabajo a diario con MaxQuant, DIA-NN...
Acerca de este Servicio
¿Necesitas ayuda con tus datos de RNA-seq? Soy un investigador universitario publicado en Scientific Reports (Nature), especializado en análisis multi-ómicos para el descubrimiento de biomarcadores.
Trabajo con DESeq2, edgeR y limma a diario, no solo en comparaciones de dos grupos, sino en diseños complejos: muestras pareadas, series temporales, experimentos multifactoriales y efectos de lote.
Lo que ofrezco:
Filtrado y normalización de calidad
Análisis de expresión diferencial (DESeq2/edgeR)
Gráficos de volcán, mapas de calor, gráficos MA, PCA de calidad de publicación
Análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes y vías (GO, KEGG, GSEA)
Scripts en R incluidos en niveles Standard y Premium
Trabajo con: matrices de conteo de featureCounts, HTSeq, STAR, Salmon o cualquier pipeline estándar.
Nota: El nivel básico cubre solo QC y análisis exploratorio, sin pruebas diferenciales.
Tecnología:
RStudio
•
Otros
Experiencia:
Diseño de experimentos
•
Estadísticas
Lenguaje de programación:
Python
•
R
FAQ
Traducción automática
P: ¿Qué necesitas de mí?
A: Tu matriz de conteo y una hoja de metadatos de muestras que describa grupos y condiciones.
Q: ¿Proporcionas código en R?
R: Los niveles Standard y Premium incluyen scripts en R comentados y específicos para el proyecto. El básico solo entrega resultados.
Q: ¿Puedes integrar datos de proteómica?
A: Sí, la integración multi-ómica es mi especialidad. Envíame un mensaje para una cotización personalizada.
P: ¿Son confidenciales mis datos?
A: Sí. Tus datos nunca se comparten, reutilizan ni publican. Puedo firmar un NDA si lo solicitas.
Q: ¿Puedes manejar efectos de lote o diseños pareados?
A: Sí, modelando covariables de lote o emparejamiento en la matriz de diseño y mostrando PCA antes/después para que puedas ver la corrección.
