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Realizaré simulaciones MD, acoplamiento molecular y análisis de datos
Acerca de este Servicio
Puedo ayudarte con:
Acoplamiento molecular y análisis de interacción proteína-ligando
Análisis post-simulación que incluye RMSD, RMSF, PCA y análisis de interacción
Modelos de estados de Markov, redes de correlación y análisis basado en gráficos
Descubrimiento de fármacos computacional y diseño molecular de novo
Análisis de datos científicos usando Python, R y MATLAB
Interpretación y visualización de resultados computacionales
Revisión y optimización de flujos de trabajo de modelado molecular
Ofrezco análisis cuidadosos, reproducibles, con interpretación científica clara y resultados listos para presentación.
Dominio:
Aprendizaje automático
Experiencia:
Aprendizaje de características
•
Análisis predictivo
Lenguaje de programación:
Python
•
R
•
MATLAB
Herramientas:
TensorFlow
•
Excel
Tecnología:
Python
•
PyTorch
•
scikit-learn
•
MATLAB
•
Pandas
•
RStudio
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué información necesitas antes de iniciar el proyecto?
Por favor, proporciona una descripción breve de tu proyecto, el tipo de análisis requerido, archivos/datos disponibles, preferencias de software si las hay y tus entregables esperados. Para proyectos de acoplamiento o MD, también proporciona estructuras de proteína/ligando y cualquier archivo de simulación o acoplamiento existente.
¿Puedes analizar trayectorias MD existentes o resultados de acoplamiento?
Sí. Puedo analizar trayectorias suministradas, poses de acoplamiento, perfiles de interacción y datos relacionados, incluyendo RMSD, RMSF, PCA, interacciones proteína-ligando, análisis conformacional y visualización científica.
¿Realizas simulaciones de dinámica molecular desde cero?
Sí, pero dependiendo de los recursos computacionales. Por favor, contáctame antes de ordenar una simulación MD completa para confirmar el alcance, plazo y costo.
¿Con qué software de modelado molecular trabajas?
Tengo experiencia con AMBER y GROMACS para simulaciones de dinámica molecular, además de acoplamiento molecular, PyMOL, RDKit, Python, R, MATLAB, Shell (scripting) y otras herramientas de biología computacional relacionadas.
¿Puedes trabajar con múltiples ligandos o complejos proteína-ligando?
Sí, pero la carga de trabajo depende del número de sistemas y del tipo de análisis requerido. Por favor, contáctame primero para proyectos con múltiples ligandos, acoplamiento a gran escala o varias trayectorias MD.
¿Proporcionarás figuras e interpretación de los resultados?
Sí. Dependiendo del paquete seleccionado, puedo ofrecer interpretación científica clara, figuras de calidad para publicaciones o presentaciones, y un resumen conciso de los hallazgos principales.
¿Puedes ayudar a revisar o solucionar problemas en mi flujo de trabajo computacional?
Sí. Puedo revisar flujos de trabajo de acoplamiento molecular, simulación MD o biología computacional, identificar problemas metodológicos, recomendar herramientas y parámetros adecuados, y ayudar a mejorar la reproducibilidad.
¿Mantendrás confidencialidad de mis datos y resultados no publicados?
Sí. Los datos del cliente, resultados no publicados, estructuras e información del proyecto serán tratados como confidenciales y utilizados únicamente para completar el trabajo acordado.
