Me encargaré del trabajo básico en bioinformática

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Transformando datos desordenados en información clara y comprensible

Profesional en bioinformática y biología computacional con experiencia práctica en Python en limpieza de datos, scripting y automatización. Me especializo en desenredar conjuntos de datos desordenados...
Acerca de este Servicio

El trabajo en bioinformática tiene muchos pasos tediosos que no aparecen en la sección de métodos de un artículo, pero que te quitan horas de tu tiempo:

- Ejecutar QC en archivos de secuenciación en crudo e interpretar el informe

- Desenredar nombres de archivos desordenados en docenas o cientos de muestras

- Arreglar un paso de pipeline que sigue fallando (Snakemake, Nextflow o un script personalizado) por incompatibilidades de formato o problemas de entorno

- Formatear metadatos para la entrega en GEO/SRA

- Cruzar una lista de genes/variantes con bases de datos y compilar un resumen limpio y anotado

Este es el trabajo pesado que es fácil de describir pero tedioso y propenso a errores al ejecutarlo, especialmente con archivos reales, desordenados y de tamaño completo. Tengo experiencia práctica usando estas herramientas y solucionando los casos límite inevitables.

Cuéntame qué está fallando o qué necesitas hacer, y envíame una muestra de tus datos. Te diré exactamente qué puedo entregar y qué tan rápido.

Tecnología:

Python

RStudio

Powershell

Experiencia:

Extracción de Datos

Manipulación de Datos