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Realizaré análisis de expresión diferencial en RNA seq y enriquecimiento de vías
Acerca de este Servicio
Ayudo a estudiantes e investigadores con análisis de datos de bioinformática y transcriptómica profesional. Los servicios incluyen análisis de RNA-seq, expresión diferencial, soporte en análisis de variantes, análisis estadístico, PCA, mapas de calor, enriquecimiento de vías y visualizaciones listas para publicación usando workflows de bioinformática en R, Python y línea de comandos en Linux. Trabajo con matrices de conteo procesadas así como archivos FASTQ en crudo para conjuntos de datos pequeños a medianos. La comunicación clara, resultados organizados y precisión en los resultados son prioritarios en cada proyecto. Por favor, contáctame antes de hacer tu pedido para discutir tu conjunto de datos y requisitos del proyecto.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Con qué tipos de conjuntos de datos trabajas?
Trabajo con RNA-seq, transcriptómica, expresión diferencial y conjuntos de datos NGS pequeños a medianos. Puedo trabajar con matrices de conteo procesadas o archivos FASTQ en crudo, dependiendo del paquete seleccionado.
¿Qué archivos necesito proporcionar?
Por favor, proporciona: archivos FASTQ o matriz de conteo metadatos de muestras/etiquetas de grupo diseño experimental información del organismo o referencia (si está disponible)
¿Necesito conocimientos de bioinformática para hacer un pedido?
No. Puedo ayudarte a explicar el flujo de trabajo, los resultados y las visualizaciones de manera clara y adecuada para la investigación.
¿Puedes analizar grandes conjuntos de datos?
Para conjuntos de datos más grandes o altamente complejos, por favor contáctame antes de hacer tu pedido para revisar los requisitos computacionales y ofrecerte una propuesta personalizada si es necesario.
¿Qué resultados recibiré?
Dependiendo del paquete, puedes recibir: tablas DEG gráficos PCA mapas de calor gráficos de volcán resultados de enriquecimiento de vías informes de control de calidad figuras listas para publicación resúmenes
¿Qué herramientas usas?
Las herramientas comunes incluyen: DESeq2 STAR featureCounts R Python flujos de trabajo en Linux/WSL
¿Debo comunicarme con usted antes de realizar un pedido?
Sí, especialmente para flujos de trabajo personalizados, conjuntos de datos grandes, comparaciones múltiples o proyectos avanzados de transcriptómica.
