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Analizaré datos de secuenciación de RNA con deseq2 y gráficos listos para publicación.
Analista de datos en bioinformática Omics
Hola, soy Maghooz Khan, un bioinformático profesional y desarrollador de IA. Trabajo en genómica, metagenómica, RNA-Seq, epigenética, metilación, análisis de CNV y proyectos de bioinformática basados ...
Acerca de este Servicio
¿Buscas análisis de RNA-seq con tablas claras, gráficos y interpretación biológica?
Analizaré datos de RNA-seq en bloque o expresión génica para investigación, tesis, manuscritos o proyectos biotecnológicos. Puedo trabajar desde archivos FASTQ, matrices de conteo, tablas de expresión y archivos de metadatos.
Los servicios incluyen:
- Control de calidad de RNA-seq y revisión de muestras
- Análisis de expresión diferencial usando DESeq2 o edgeR
- PCA, agrupamiento de muestras, gráficos de volcán y mapas de calor
- Enriquecimiento GO, KEGG, Reactome o GSEA
- Tablas limpias de DEG y resúmenes de expresión génica
- Informe en Word/PDF con interpretación clara
- Código de flujo de trabajo en R/Python o Linux cuando sea necesario
Las herramientas pueden incluir FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, featureCounts, DESeq2, edgeR, clusterProfiler, ggplot2, R, Python y Linux.
Por favor, envíame un mensaje antes de hacer el pedido para confirmar el número de muestras, grupos, comparaciones, archivos de entrada y el mejor paquete para tu proyecto.
FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos necesitas para empezar?
Necesito archivos FASTQ, matriz de conteo, archivo de metadatos, detalles del grupo de muestras y las comparaciones que quieres analizar.
¿Puedes analizar archivos FASTQ en crudo?
Sí, puedo analizar archivos FASTQ en crudo usando un flujo de trabajo completo de RNA-seq, que incluye control de calidad, alineación o cuantificación, generación de conteos y análisis downstream.
¿Puedes trabajar solo con una matriz de conteo?
Sí, si ya tienes una matriz de conteo y metadatos, puedo realizar análisis de expresión diferencial, visualización, enriquecimiento y elaboración de informes.
¿Proporcionas gráficos listos para publicación?
Sí, puedo ofrecer gráficos PCA, volcano plots, mapas de calor, gráficos de barras, gráficos de puntos y figuras de enriquecimiento de vías.
