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Analizaré datos de secuenciación de rna de célula única humana con anotación de células
Analista de bioinformática secuenciación de RNA visualización de datos científicos
Analista de bioinformática especializado en RNA-seq en masa de humanos, análisis de expresión génica y visualización de datos científicos. Ayudo a investigadores a convertir matrices de conteo y metad...
Acerca de este Servicio
Convierte tus datos de rna de célula única humana en conocimientos biológicos claros, estructurados y listos para publicación.
Ofrezco un flujo de trabajo de análisis cuidadoso y consciente de la identidad que mantiene la relación entre células, muestras y sujetos a lo largo del proyecto. Tus resultados se entregarán con figuras de alta calidad, tablas organizadas y una interpretación científica clara.
Dependiendo del paquete que elijas, el análisis incluye:
Validación de matriz de conteo y metadatos
Control de calidad por muestra
Detección y filtrado de dobletes
Normalización, PCA, UMAP y agrupamiento
Integración y revisión de efectos de lote
Identificación de genes marcadores
Anotación de tipos celulares basada en evidencia
UMAP, diagramas de puntos y mapas de calor listos para publicación
Archivos H5AD organizados y tablas de resultados
Expresión diferencial pseudobulk consciente del sujeto
Análisis de composición celular a nivel de muestra
Informe estructurado de análisis y registros de calidad
Este servicio es ideal para estudios de células únicas en múltiples muestras en investigación biomédica, farmacéutica y biotecnológica. Combino análisis bioinformático con visualización científica para ofrecer resultados claros, confiables y listos para informes de investigación, presentaciones y publicación.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué datos de entrada aceptas?
Trabajo con una matriz de conteo de genes enteros por célula y metadatos coincidentes. Por favor, proporciona el mapeo célula-muestra, IDs de sujetos, etiquetas de condición y identificadores de genes cuando estén disponibles.
¿Procesas archivos FASTQ en bruto?
Estos paquetes comienzan desde una matriz de conteo entero. La alineación y cuantificación en FASTQ sin procesar no están incluidas. Contacta conmigo si tus datos están en una etapa de procesamiento anterior.
¿Cómo realizas la anotación de tipos celulares?
Utilizo genes marcadores, patrones de expresión en agrupamientos y referencias biológicas disponibles. La anotación se basa en evidencia, y las poblaciones inciertas o conflictivas se identifican claramente para revisión.
¿Cómo se analiza la expresión diferencial?
Cuando el diseño del estudio lo permite, el paquete Premium usa análisis pseudobulk consciente del sujeto. Las células proporcionan profundidad de medición, mientras que los sujetos biológicos definen la replicación estadística.
¿Incluyen scripts reproducibles de análisis?
Los scripts y notebooks en R o Python no están incluidos por defecto. Los scripts reproducibles se pueden comprar como un Extra de pago después de revisar el alcance, formato de datos y entorno requerido.
¿Puedes garantizar marcadores específicos o resultados significativos?
Los resultados dependen de la calidad de los datos, el diseño del estudio, la variación biológica y la replicación de muestras. Ofrezco un análisis riguroso y transparente, pero no puedo garantizar marcadores específicos ni significancia estadística.
¿Qué análisis no están incluidos en estos paquetes?
Análisis de transcriptómica espacial, scATAC-seq, multiome, trayectoria, comunicación célula-célula, red regulatoria y CNV requieren una revisión de factibilidad y precios por separado.
