Analizaré datos de rna seq en masa y expresión génica
Analista de bioinformática secuenciación de RNA visualización de datos científicos
Acerca de este Servicio
Convierte tus datos de rna-seq en masa o expresión génica en resultados claros, confiables y listos para publicación.
Ayudo a investigadores, laboratorios y equipos biotecnológicos a transformar matrices de expresión complejas en conocimientos biológicos bien organizados usando flujos de trabajo en R y Bioconductor adaptados a cada diseño de estudio.
Los servicios pueden incluir:
- Verificación de entrada, metadatos e identidad de muestras
- Control de calidad, revisión del tamaño de la biblioteca, PCA y diagnóstico de muestras
- Filtrado, normalización y análisis de expresión diferencial
- Tablas completas de resultados, gráficos de volcán y figuras listas para publicación
- Mapas de calor de DEG y análisis de vías GO, Reactome y KEGG
- Análisis de sensibilidad y concordancia para proyectos avanzados
- Métodos claros, resumen de resultados y registros estructurados de QA
Recibirás salidas cuidadosamente organizadas que son fáciles de revisar, interpretar y usar en informes, presentaciones, manuscritos o análisis posteriores. Me enfoco en claridad estadística, visualización de alta calidad y comunicación clara durante todo el proyecto.
Por favor, envíame un mensaje antes de ordenar para entender tus datos, la pregunta de investigación y las comparaciones que deseas.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos necesito proporcionar?
Por favor, proporciona una matriz de conteo o expresión a nivel de gen, metadatos de muestras, etiquetas de grupo, tipo de ID de gen y las comparaciones que necesitas. Una breve descripción de tu pregunta de investigación también ayuda.
¿Procesas archivos FASTQ en bruto?
Este Gig se enfoca en el análisis downstream de matrices de conteo a nivel de gen o matrices de expresión validadas. El control de calidad de archivos FASTQ en crudo, alineación y cuantificación requieren un alcance personalizado separado.
¿Qué paquete debo elegir?
Lo básico cubre control de calidad enfocado y expresión diferencial. El estándar añade diagnósticos, un mapa de calor de DEG y análisis de vías. La opción premium soporta estudios más grandes, hasta dos contrastes, análisis de sensibilidad y QA ampliado.
¿Incluyen scripts en R o Python?
Los scripts reproducibles en R o Python y los notebooks no están incluidos por defecto. Pueden proporcionarse como un extra personalizado de pago tras revisar los datos, el entorno y el alcance del código requerido.
¿Puedes analizar diseños de estudio pareados o complejos?
Sí, se soportan comparaciones simples pareadas y no pareadas en el paquete adecuado. Diseños multifactoriales, de interacción, longitudinales u otros diseños complejos requieren una revisión de viabilidad y una oferta personalizada.
¿Puedes garantizar genes o vías significativas?
La significancia estadística depende de los datos, tamaño de muestra y efecto biológico. Ofrezco resultados completos y transparentes, reportando claramente hallazgos tanto significativos como no significativos.
¿Qué recibiré?
Dependiendo de tu paquete, recibirás tablas de resultados organizadas, figuras en alta resolución, métodos, resumen de resultados y registros de QA. Los paquetes avanzados incluyen análisis de vías y sensibilidad.
¿Qué cubre una revisión?
Una revisión cubre correcciones, cambios de formato o aclaraciones dentro del alcance acordado del análisis. Nuevos conjuntos de datos, comparaciones, métodos o módulos de análisis requieren un extra o oferta personalizada.

