Ejecutaré simulación de dinámica molecular con GROMACS y analizaré tu proteína

¿Necesitas una simulación de dinámica molecular pero estás atascado en la configuración, errores o análisis? Soy un investigador en biotecnología con experiencia práctica en GROMACS, y llevaré tu proteína desde el archivo PDB hasta gráficos listos para publicación.

Lo que obtienes:

• Preparación completa del sistema (campo de fuerza CHARMM36, agua explícita TIP3P, neutralización con iones)
• Minimización de energía, equilibration NVT y NPT, MD de producción
• Limpieza de trayectoria (corrección PBC, ajuste)
• Análisis: RMSD, RMSF, radio de giro, enlaces de hidrógeno, SASA, estructura secundaria y PCA (según el paquete)
• Gráficos limpios y etiquetados (PNG, alta resolución) además de los archivos de datos en bruto
• Un resumen breve de métodos que puedes adaptar para tu propio informe

Por favor, ten en cuenta: Yo proporciono la simulación y el análisis. La interpretación y redacción de tu propia investigación siguen siendo tuya. La duración de la simulación y el tamaño del sistema dependen de los límites de computación, así que envíame un mensaje primero con tu ID o archivo PDB y confirmaré la viabilidad.

¿No estás seguro de qué paquete se ajusta? Envíame un mensaje y te recomendaré uno.