Realizaré análisis de secuenciación de ARN de célula única y anotación de tipos celulares

¿Tienes datos de RNA-seq de célula única que necesitan 

análisis profesional e identificación de tipos celulares?

Analizaré tu conjunto de datos scRNA-seq usando Seurat 

y entregaré una anotación completa de tipos celulares con 

visualizaciones listas para publicación.

LO QUE OBTIENES:

- Control de calidad y filtrado de células de baja calidad

- Normalización y escalado

- Reducción de dimensionalidad PCA

- Agrupamiento basado en grafos

- Visualización UMAP

- Identificación de genes marcadores por grupo

- Anotación de tipos celulares biológicos

- Informe completo de análisis

MI EXPERIENCIA:

Analicé 2,700 PBMCs humanas identificando 9 

poblaciones celulares distintas, incluyendo células T, B, NK, 

monocitos, células dendríticas y plaquetas usando Seurat.

Pipeline completo disponible en GitHub.

LO QUE NECESITO DE TI:

- Archivos de salida de 10X Genomics (códigos de barras, características, matriz)

 O matriz de conteo procesada

- Nombre del organismo (humano, ratón, etc.)

- Cualquier información biológica conocida sobre tu muestra

HERRAMIENTAS: R, Seurat, ggplot2, dplyr, UMAP, 

    PCA, Git, Linux

Envíame un mensaje antes de ordenar para discutir 

tu conjunto de datos. Primero confirmaré la viabilidad.