Realizaré análisis de expresión diferencial en rnaseq en tu conjunto de datos

¿Eres un investigador o científico con datos de RNA-seq

que necesita un análisis profesional?

Analizaré tu conjunto de datos de RNA-seq e identificaré

genes diferencialmente expresados usando DESeq2, entregando

resultados listos para publicación.

LO QUE OFREZCO:

- Alineación al genoma de referencia usando HISAT2

- Análisis de expresión diferencial con DESeq2

- Gráfico de volcán y mapa de calor de los principales DEGs

- Informe completo en HTML de análisis

- Scripts limpios y documentados en R y Python

LOS ENTREGABLES INCLUYEN:

- Resultados de expresión diferencial con DESeq2

- Análisis de enriquecimiento de procesos biológicos GO

- Análisis de rutas de Reactome con vías clínicas

- Figuras listas para publicación

- Informe completo en HTML

MI EXPERIENCIA:

Construí una pipeline completa de RNA-seq analizando datos reales de genómica de cáncer de mama del conjunto de datos NCBI

PRJNA432903. Identifiqué 2298 DEGs significativos con

PC1 explicando el 86% de la varianza.

LO QUE NECESITO DE TI:

- Archivos FASTQ en crudo o matriz de conteo preprocesada

- Genoma de referencia o nombre del organismo

- Condiciones experimentales e información de las muestras

HERRAMIENTAS UTILIZADAS:

R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash,

Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano

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