Realizaré análisis de rnaseq, atacseq o scrnaseq con bioinformática completa

¿Buscas un análisis limpio, perspicaz y reproducible de tus datos de secuenciación?

Me especializo en análisis de datos de alto rendimiento, incluyendo RNA-seq, ATAC-seq y single-cell RNA-seq (scRNA-seq). Ya sea que trabajes con muestras en masa o conjuntos de datos complejos de células individuales, puedo ofrecerte una pipeline completa desde el control de calidad hasta análisis avanzados posteriores.

Ofrezco:

• Control de calidad (FastQC, MultiQC)
• Alineación y cuantificación
• Análisis de expresión diferencial/accesibilidad
• Detección de picos (para ATAC-seq)
• Reducción de dimensionalidad, agrupamiento, clasificación celular (para scRNA-seq)
• Visualización (heatmaps, PCA, gráficos de volcán, UMAP/tSNE)
• Enriquecimiento funcional (GO/KEGG)
• Gráficos personalizados para publicación

Herramientas que uso: R, Seurat, DESeq2, edgeR, MACS2, Galaxy, Bioconductor, Scanpy

¡Convirtamos tus datos en conocimientos biológicos!