Haré análisis bioinformático de secuenciación de rna bulk y de célula única

Soy un bioinformático que ofrece análisis de RNA-seq usando herramientas estándar de la industria como DESeq2, Scanpy y Cytoscape, no pipelines automatizados de caja negra. Cada script se ejecuta y revisa manualmente antes de entregar, por lo que los resultados son precisos y están listos para tu tesis, disertación o manuscrito.

RNA-Seq de expresión diferencial básico en bulk

Análisis con DESeq2 a partir de tu tabla de recuentos en crudo. Obtienes un gráfico de volcán, un mapa de calor de los genes más significativos, una tabla en Excel con Log2FC y valores p ajustados, y un párrafo corto de métodos. Listo para publicación, 300dpi.

STANDARD + Red de interacción proteína-proteína

Todo en Básico, más una red de interacción de proteínas basada en STRING construida en Cytoscape, con identificación de genes centrales (cytoHubba) y una tabla con tus 10 principales genes centrales.

Análisis de RNA-seq de célula única premium

Pipeline completo en Scanpy: control de calidad, agrupamiento y visualización UMAP. Los tipos de células se etiquetan con marcadores reales, no con suposiciones. Incluye gráfico UMAP, gráficos de violín para genes marcadores y una tabla de genes marcadores por grupo.

Siempre confirmo que los nombres de las muestras coincidan entre tus archivos antes de comenzar, esto previene errores en tus resultados.