Analizaré datos de secuenciación de inmunoreceptores tcr bcr

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Soluciones sencillas para datos biomédicos complejos

Hola, me llamo Jonathan Alles. Soy consultor independiente en bioinformática e ingeniería de datos. A través de mi agencia, EVOBYTE Digital Biology, apoyo a profesionales en ingeniería y análisis de d...

Nivel 1

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Acerca de este Servicio

¿Necesitas ayuda para analizar, integrar o interpretar datos de secuenciación de inmunoreceptores, de ensayos (de célula única) TCR o BCR-seq?


Lo que ofrezco:

Análisis de bioinformática

  • Procesamiento bioinformático de datos en crudo de secuenciación
  • Agregación, filtrado, limpieza
  • Anotación de metadatos
  • Alineación y cuantificación de secuencias TCR/BCR
  • Estadísticas de uso de genes y comparación estadística
  • Seguimiento de TCR/BCR
  • Clustering de receptores
  • Integración con fuentes de datos públicas (por ejemplo, VDJ-DB)

Visualización y reporte

  • Cuaderno Jupyter con código de análisis
  • Reportes personalizados en PDF o HTML
  • Tableros para consulta de datos

Desarrollo de pipelines y automatización

  • Automatización y escalado de pipelines de análisis
  • Integración con bases de datos y en la nube
  • Contenerización

Curación de datos

  • Curación y ensamblaje de paquetes de datos de literatura o repositorios públicos


Pila tecnológica

Python / Pandas / scipy / Jupyter / TF / Bash / MiXCR / Paquetes de Python para bioinformática de TCR/BCR


Construyamos juntos

¿Tienes un proyecto en mente? Envíame un mensaje para discutir tus requisitos y te ofreceré un plan y una propuesta personalizados que se ajusten perfectamente a tus objetivos.

Lenguaje de programación:

Python

Otros

Tecnología:

Excel

Jupyter Notebook

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis cualitativo

Experiencia:

Diseño de experimentos

Algoritmos

Estadísticas

Herramientas:

Otros

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