Realizaré acoplamiento molecular, simulación MD y análisis ADMET

Hola,

Soy un investigador especializado en bioinformática y química computacional. Si necesitas acoplamiento molecular, simulaciones de dinámica molecular (MD) o perfilado ADMET para tu proyecto de investigación, tesis o artículo, puedo ayudarte a configurarlo y ejecutarlo.

Realizo simulaciones usando GPUs en la nube de alto rendimiento (principalmente GROMACS y AutoDock Vina) para ofrecer resultados rápidos y precisos.

Lo que puedo hacer por ti:

Acoplamiento molecular: acoplamiento proteína-ligando (AutoDock Vina, PyRx), acoplamiento específico de sitio o ciego, cribado virtual y visualización de poses (PyMOL/Discovery Studio).

Simulaciones MD: configuración del sistema, equilbración y ejecuciones de producción (de 10ns a más de 100ns) en GROMACS o NAMD. Analizaré RMSD, RMSF, Rg, SASA, enlaces de hidrógeno y energía de unión MM-PBSA.

ADMET y similitud con fármacos: perfilado SwissADME/pkCSM y filtros de la Regla de Cinco de Lipinski.

Modelado por homología: modelado de estructura 3D de proteínas (SWISS-MODEL/Modeller) y validación.

Lo que recibirás:

Un informe limpio y profesional con figuras listas para publicación.

Todos los archivos de salida en bruto (.pdbqt, .gro, .xtc, .xvg, etc.) para tus registros.

Una sección metodológica escrita que podrás formatear fácilmente para tu artículo o tesis.