Realizaré análisis epigenético integrador

Lo que incluye:

ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run/Tag

Control de calidad exhaustivo

Alineación + llamada de picos (Bowtie2/MACS3)

Picos de consenso, superposición y señal.

Análisis de picos diferenciales (DiffBind)

Visualización: PCA, gráfico de volcán interactivo.

Anotación de picos genómicos (ChIPseeker)

Anotación funcional de picos (ENCODE-SCREEN)

Tracks del genoma para visualización (BigWig)

Anotación personalizada con conjuntos de datos de interés.

Footprinting de proteínas basado en evidencia (LOLA/ReMap2022)

Análisis de motivos conocidos y de novo (HOMER).

Análisis de vías basado en dominios regulatorios (GREAT)

Informe biológico

Informe de QC

Informe técnico

Revisiones menores y consultoría.