Desarrollaré pipelines reproducibles de omics

Pipelines reproducibles de RNA-Seq, DNA-Seq y Ribo-Seq

¿Trabajas con datos de RNA-Seq, DNA-Seq o Ribo-Seq y necesitas flujos de análisis robustos y reproducibles?

Construiré pipelines personalizados de omics usando Snakemake o Nextflow, diseñados para escalabilidad, claridad y reproducibilidad.

Mis pipelines siguen las mejores prácticas en bioinformática y son modulares, bien documentados y controlados por entorno (Conda o virtualenv). Ya sea que proceses una sola muestra o un lote completo de experimentos, te ayudaré a automatizar QC, alineación, cuantificación y análisis diferencial con flexibilidad para integrar herramientas y visualizaciones posteriores.

Este servicio incluye flujos de trabajo de análisis de RNA-Seq totalmente automatizados usando herramientas como STAR, HISAT2 y DESeq2 desde archivos FASTQ en bruto hasta la expresión diferencial final y visualización.

• Flujos de trabajo para muestras individuales y múltiples
• Reglas y parámetros configurables
• Estructura de salida clara y documentación
• Compatible con ejecución local o en HPC
• Salidas listas para ML y ganchos de enriquecimiento opcionales

Agiliza tu análisis de omics y asegúrate de que esté listo para publicación, sea reproducible y esté preparado para el futuro.

Contáctame para discutir tu proyecto antes de hacer un pedido.