Ejecutaré simulación de dinámica molecular y análisis

¿Necesitas una simulación de dinámica molecular MD confiable para tu proteína o complejo proteína-ligando? Ofrezco simulaciones y análisis de nivel investigativo usando GROMACS, ayudando a investigadores y estudiantes a validar la estabilidad estructural y el comportamiento de unión a lo largo del tiempo.

Lo que ofrezco: simulaciones MD de proteínas o complejos proteína-ligando con configuración del sistema, minimización de energía, equilibración y ejecuciones de producción. El análisis posterior a la simulación incluye RMSD, RMSF, radio de giro, análisis de enlaces de hidrógeno y cálculos opcionales de energía libre de unión MM-PBSA/GBSA.

Herramientas: GROMACS, VMD, PyMOL, Xmgrace para gráficos.

Recibes: un informe PDF detallado con todos los gráficos de análisis, archivos de trayectoria/resultado en bruto y un resumen claro de los hallazgos sobre la estabilidad estructural.

Por qué elegirme: experiencia práctica en todo el proceso computacional desde el acoplamiento hasta MD y análisis de energía libre, para entender cómo encajan tus resultados de simulación en el panorama general de tu proyecto.

Ten listo: la estructura de tu proteína (archivo PDB) y, si aplica, la estructura del ligando (PDB/MOL2/SDF). Indícame la duración deseada de la simulación o déjalo a mi recomendación.

Envíame los detalles de tu sistema para una cotización personalizada y empecemos con tu simulación.