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Haré acoplamiento molecular y simulaciones de MD
Acerca de este Servicio
Como fundador y CEO de DockDynamics, ofrezco simulaciones de acoplamiento molecular y dinámica molecular (DM) de nivel experto para apoyar proyectos de descubrimiento de fármacos computacionales. Si buscas un diseñador de fármacos experto, estás en el lugar correcto. Te ayudaré con proyectos relacionados con el diseño de fármacos y vacunas. Como bioinformático profesional, entrego resultados reproducibles, confiables y listos para publicación.
Herramientas y recursos:
Acoplamiento proteína-ligando (AutoDock Vina, PyRx, MOE)
Simulaciones de DM (GROMACS/AMBER/NAMD)
Análisis de interacción y estabilidad (RMSD, RMSF, Rg, SASA, PCA, DCCM, MMGBSA)
Cálculos de energía y visualizaciones (PyMOL, Chimera, Discovery Studio, LigPlus)
Análisis ADMET y RO5 (SwissADME, AdmetSAR, ProTox-II)
Incluye informes detallados, gráficos y scripts reproducibles (bajo solicitud)
¿Por qué elegirme?
1. Entrega rápida de pedidos
2. Revisiones
3. Satisfacción total del cliente
4. Garantía de devolución del dinero
5. Tarifas asequibles
No dudes en contactarme para personalizar tu pedido.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos de entrada necesitas de mí?
Por lo general, necesito tu estructura de proteína (formato PDB) y ligando(s) en formato MOL2/SDF/PDBQT.
¿Qué software utilizas?
Utilizo AutoDock Vina, PyRx, MOE para acoplamiento, y NAMD, GROMACS (o AMBER si lo solicitas) para simulaciones MD. Las visualizaciones se crean con PyMOL, Chimera o VMD.
¿Puedes realizar simulaciones para cualquier proteína objetivo?
Sí, siempre que exista una estructura 3D válida (PDB o modelo por homología), puedo realizar docking y simulaciones MD para ella.
¿Recibiré un informe?
Sí, cada paquete de simulación incluye un informe PDF detallado con métodos, resultados, gráficos (por ejemplo, RMSD, RMSF) y visualizaciones de unión.
¿Son estos resultados adecuados para publicación o trabajo de tesis?
Por supuesto, proporciono visualizaciones y datos listos para publicación.
¿Mis datos se mantienen confidenciales?
Sí. Tus datos son completamente confidenciales y firmo un acuerdo de confidencialidad (NDA) si lo requieres.
