Crearé una pipeline automatizada de análisis de secuencias fasta en bash y python

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transicionando hacia la bioinformática

Actualmente desarrollando habilidades en flujos de trabajo en terminal de Linux, bases de datos NCBI/EMBL-EBI y análisis de secuencias. 🎯 Con la intención de contribuir a herramientas de bioinformáti...
Acerca de este Servicio

¿Buscas una pipeline automatizada confiable y de alta velocidad para procesar secuencias biológicas FASTA sin trabajo manual? 


Me especializo en construir pipelines modulares y reproducibles en Bash y Python, diseñadas para la extracción de secuencias FASTA de NCBI y análisis bioinformático posterior.


### Lo que ofrezco en este gig:

- Recuperación automatizada de secuencias NCBI: descarga en lote de secuencias FASTA usando IDs de acceso.

- Estadísticas y métricas de secuencias: calcular longitud total, porcentajes de contenido GC/AT y estadísticas N50.

- Perfil de GC en ventanas: análisis detallado del contenido GC en ventanas deslizantes.

- Manipulación de secuencias: generación automática de complementos inversos y limpieza de encabezados FASTA.

- Exportación de datos estructurados: informes limpios en TSV/CSV para análisis posterior.


### ¿Por qué elegir mi servicio?

- Código limpio y bien documentado: scripts modulares en Bash y Python diseñados para reutilización sencilla.

- Flujos de trabajo optimizados para almacenamiento: ejecución eficiente en línea de comandos en entornos Linux.

- Rápido tiempo de entrega y soporte completo: instrucciones detalladas para una ejecución sin problemas en tu terminal.


No dudes en enviarme un mensaje con los requisitos específicos de tu proyecto antes de hacer un pedido.

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