Descargaré y alinearé tus muestras fastq con el genoma.

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Como investigadora con doctorado en el Centro Nacional de Investigación del Cáncer, me especializo en ofrecer análisis bioinformáticos avanzados, especialmente en áreas clave como RNA-seq, CRISPR-Scre...

Nivel 1

Ha cumplido determinados criterios de rendimiento y muestra un gran potencial en la plataforma.

Acerca de este Servicio

Los datos públicos de microarrays o RNAseq son muy útiles para diversos análisis. Estos archivos son muy pesados y se requiere una potente infraestructura computacional para obtenerlos. Con un procesador de alto rendimiento (HPC) Linux, descargaré todos sus datos (muestras fastq) de bases de datos públicas como SRA, ENA, NIH, etc. Los alinearé con el genoma (humano, murino, de pez cebra, etc.) utilizando STAR o el alineador Salmon, y le proporcionaré los recuentos brutos con los que podrá realizar análisis posteriores.


Además, te proporcionaré un informe html con las métricas, estadísticas y pasos de control de calidad de las muestras alineadas.


Cada muestra costará $5


Si tienes alguna duda escríbeme y hablamos!

Tecnología:

Python

RStudio

Otros

Tipo de información:

Listas

Otros

Técnica:

Manual