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Analizaré tus datos de secuenciación de rna de célula única y proporcionaré insights personalizados
Codificando el futuro de la biología
Genyx LLC es una empresa de biotecnología, bioinformática y software impulsado por IA que desarrolla soluciones de próxima generación para genómica, atención médica y ciencias de la vida. Nos especial...
Acerca de este Servicio
Ofrezco análisis personalizado de secuenciación de rna de célula única adaptado a tu conjunto de datos y objetivos de investigación. Cada proyecto se ajusta a la pregunta biológica, aplicando flujos de trabajo reproducibles en R o Python (Seurat, Scanpy, etc.) para entregar resultados de alta calidad e interpretables.
Los servicios incluyen:
- Control de calidad y filtrado
- Normalización, escalado y reducción de dimensionalidad (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering e identificación de genes marcadores
- Opcional: anotación de tipos celulares y enriquecimiento de vías
- Generación de visualizaciones listas para publicación e informes resumidos
Con más de cuatro años de experiencia en bioinformática y múltiples disciplinas ómicas, aseguro que cada análisis sea robusto, transparente y biológicamente significativo. Por favor, contáctame antes de ordenar para discutir tus datos y objetivos de análisis.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué tipo de datos puedo proporcionar?
Puedes proporcionar archivos FASTQ en crudo (para procesar con Cell Ranger o equivalente) o matrices de conteo procesadas (por ejemplo, .mtx, .h5 o .csv). Adaptaré el flujo de trabajo según el tipo de datos y tus objetivos de proyecto.
¿Realizas procesamiento de datos en crudo (FASTQ a matriz de conteo)?
Sí. Este paso puede añadirse como un servicio adicional e incluye alineación de lecturas, conteo de UMI y generación de la matriz de expresión adecuada para análisis posteriores.
¿Qué herramientas utilizas para el análisis?
Principalmente uso Seurat, Scanpy, Monocle3 y Cell Ranger, junto con paquetes estándar de R y Python para visualización y análisis de enriquecimiento.
¿Puedes integrar múltiples muestras o lotes?
Sí. La corrección de lotes y la integración de múltiples muestras pueden incluirse como complemento. Uso Seurat v4, Harmony o Scanorama, dependiendo de las características del conjunto de datos
¿Cómo discutimos la pregunta biológica o el plan de análisis?
Antes de comenzar, intercambiaremos algunos mensajes para definir tus objetivos principales y detalles de los datos. Luego, confirmaré el mejor paquete o sugeriré una oferta personalizada si es necesario.
