Haré análisis de rnaseq NGS desde lecturas en crudo hasta expresión diferencial.

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Farah Saleem

Pakistán

Hablo Urdu, Inglés

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Donde la experiencia en investigación se encuentra con la excelencia en escritura académica

Soy bioinformático, investigador y escritor académico con conocimientos avanzados en Python, C, C++ y desarrollo front-end (HTML, CSS, JavaScript, Bootstrap). Mi sólida formación en ciencia de datos, ...
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Acerca de este Servicio

Ofrezco análisis completo de RNA-seq y NGS, desde las lecturas de secuenciación en bruto hasta los resultados de expresión diferencial y visualizaciones listas para publicación.

Lo que entrego:

  • Control de calidad y recorte de lecturas (FastQC, fastp)
  • Alineación/cuantificación (Salmon)
  • Análisis de expresión diferencial (DESeq2 en R)
  • Visualizaciones: gráficos de volcán, gráficos PCA, mapas de calor
  • Análisis de vías/enriquecimiento (GO/KEGG) paquete premium
  • Modelado predictivo basado en ML con datos de expresión paquete premium

Herramientas: Python, R, Salmon, DESeq2, tximport, ggplot2

Ya sea que necesites todo el pipeline o ayuda con solo una etapa, por ejemplo, si ya tienes una matriz de counts y solo necesitas análisis de expresión diferencial y gráficos, puedo comenzar desde donde estén tus datos actualmente.

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do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
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