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Analizaré datos de rna seq usando deseq2, edger, go, kegg y pca
Transformo ciencia compleja en contenido claro e impactante
Soy biólogo y científico de datos con más de 2 años de experiencia en instituciones de Estados Unidos, especializado en bioinformática, genómica y redacción científica. Conecto los datos biológicos co...
Acerca de este Servicio
¿Buscas un análisis de RNA-seq riguroso y listo para publicación, no solo un script que genera un CSV?
Soy el Dr. Faisal, biólogo molecular de plantas con doctorado y investigador postdoctoral (Connecticut Agricultural Experiment Station, EE.UU.) con más de 35 publicaciones revisadas por pares y experiencia práctica en RNA-seq en más de 20 especies.
LO QUE OBTIENES:
QC (FastQC/MultiQC)
Recorte y alineación (HISAT2/STAR o kallisto/salmon)
Diferencial de expresión (DESeq2/edgeR)
PCA, gráficos de volcán, mapas de calor
Análisis de enriquecimiento GO y vías KEGG
Interpretación biológica escrita
PARA QUIÉN ES ESTO:
Estudiantes de posgrado, postdoctorados y laboratorios con datos crudos de FASTQ o conteo que necesitan un análisis correcto, de nivel publicación, no solo números.
LO QUE NECESITO DE TI:
Archivos FASTQ, matriz de conteo o accesos SRA
Diseño experimental (qué muestras corresponden a qué grupo)
Genoma de referencia/especie
Envíame un mensaje antes de hacer el pedido si tu conjunto de datos es grande o de una especie no modelo, para poder darte una cotización precisa.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué datos de entrada necesitas de mí?
¡Necesito tus datos crudos de RNA-seq (archivos FASTQ) o matriz de conteo! También necesito los metadatos de tus muestras (condiciones, réplicas, etc.). Si tienes información del genoma de referencia, compártela también.
¿Qué herramientas de bioinformática utilizas?
Utilizo herramientas estándar como DESeq2, edgeR, limma-voom, ggplot2, pheatmap, clusterProfiler y otras para enriquecimiento GO y KEGG. Todo el código es reproducible y te lo proporciono.
¿Proporcionas el código/script en R?
¡Sí! Para los paquetes Estándar y Premium, proporciono el script completo en R utilizado para el análisis. Esto garantiza que tu análisis sea completamente reproducible.
¿Puedes manejar conjuntos de datos mayores a 24 muestras?
¡Sí! Si tienes más de 24 muestras, envíame un mensaje antes de ordenar. Puedo ofrecerte una cotización personalizada según el tamaño específico de tu conjunto de datos.
