Analizaré datos de rna seq usando deseq2, edger, go, kegg y pca

¿Buscas un análisis de RNA-seq riguroso, listo para publicación, no solo un script que genera un CSV?

Soy el Dr. Faisal, biólogo molecular de plantas con doctorado y investigador postdoctoral (Connecticut Agricultural Experiment Station, EE. UU.) con más de 35 publicaciones revisadas por pares y experiencia práctica en RNA-seq en más de 20 especies.

LO QUE OBTIENES:

QC (FastQC/MultiQC)

Recorte y alineación (HISAT2/STAR o kallisto/salmon)

Expresión diferencial (DESeq2/edgeR)

PCA, gráficos de volcán, mapas de calor

Análisis de enriquecimiento GO y vías KEGG

Interpretación biológica escrita

PARA QUIÉN ES ESTO:

Estudiantes de posgrado, postdoctorados y laboratorios con datos crudos FASTQ o de conteo que necesitan un análisis correcto, de nivel publicación, no solo números.

LO QUE NECESITO DE TI:

Archivos FASTQ, matriz de conteo o accesos SRA

Diseño experimental (qué muestras pertenecen a qué grupo)

Genoma de referencia/especie

Envíame un mensaje antes de ordenar si tu conjunto de datos es grande o de una especie no modelo, para poder ofrecerte una cotización precisa.