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Realizaré simulaciones MD de proteínas modificadas y complejos de ligandos
Profesor asociado de Química Física
Soy Ephriem Mengesha, doctor en Química Física y profesor asociado con más de 15 años de experiencia en investigación y docencia. Ofrezco servicios freelance en química computacional, acoplamiento mol...
Acerca de este Servicio
Ofrezco simulaciones de dinámica molecular (MD) profesionales usando Schrödinger Maestro (Desmond) para proteínas, complejos proteína-ligando y proteínas covalentemente modificadas. Mis servicios incluyen preparación del sistema, configuración de la simulación, ejecuciones de MD de producción y análisis completo de la trayectoria (RMSD, RMSF, radio de giro, SASA, enlaces de hidrógeno, estructura secundaria y más). Recibirás figuras de calidad para publicación, archivos de simulación y un informe científico claro para apoyar tu investigación o desarrollo de productos.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué información necesitas para iniciar el proyecto?
Normalmente necesito la estructura de la proteína (archivo PDB o ID de PDB), estructura del ligando (si aplica), detalles de modificaciones covalentes o mutaciones, tus objetivos de investigación y la duración deseada de la simulación. Si no estás seguro, puedo ayudarte a determinar la mejor configuración.
¿Puedes simular proteínas químicamente modificadas o complejos covalentes proteína–ligando?
Sí. Puedo modelar proteínas modificadas covalentemente.
¿Qué recibiré al final del proyecto?
Recibirás los archivos de entrada y salida de la simulación, archivos de trayectoria, gráficos de análisis de calidad para publicación (como RMSD, RMSF, Rg, SASA y estructura secundaria) y un informe conciso que explica los resultados y compara la estabilidad estructural de tus sistemas.
