Haré análisis de bioinformática de secuenciación de rna, metagenómica y microbioma 16s

Tienes los archivos FASTQ. Lo que necesitas es alguien que pueda convertirlos en resultados que tu PI y los revisores aceptarán.

Analizo datos de secuenciación para investigadores y equipos de biotecnología, y también publico los míos propios. Mi trabajo en microbioma y neurofarmacología ha sido publicado en revistas revisadas por pares, así que escribo resultados de la forma en que los revisores esperan leer.

Lo que manejo:

amplicones de 16S y ITS: QIIME2 o DADA2, diversidad alfa y beta, taxonomía, abundancia diferencial

RNA-seq en masa: alineación, DESeq2 o edgeR, enriquecimiento GO y KEGG

Metagenómica shotgun: MetaPhlAn, recuperación de MAG, perfilado funcional

Células individuales: agrupamiento con Seurat, genes marcadores, UMAP

Variantes: mejores prácticas con GATK, GWAS

Recibes gráficos de volcán, mapas de calor, figuras de PCoA y UMAP a 300 DPI, estadísticas hechas correctamente con corrección por pruebas múltiples, código documentado que puedes volver a ejecutar, y un párrafo de métodos escrito para tu manuscrito.

Trabajo con FASTQ, BAM, VCF, matrices de conteo, o un acceso a GEO o SRA, de Illumina, Nanopore o PacBio.

Envíame un mensaje con tu pregunta de investigación y el número de muestras y te diré honestamente qué pueden soportar tus datos antes de que hagas tu pedido.