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Realizaré análisis de bioinformática de datos de secuenciación
Analista de bioinformática y coordinador de investigación clínica
Soy graduado en Bioinformática con maestría, profesional en atención sanitaria y coordinador de investigación clínica especializado en enfermedades infecciosas y microbioma. Apoyo a equipos académicos...
Acerca de este Servicio
Brindo soporte práctico y reproducible en bioinformática para proyectos de secuenciación e investigación del microbioma.
Puedo ayudar con organización de metadatos, verificaciones de muestras y IDs de ejecución, control de calidad FASTQ, recorte de adaptadores y calidad, informes MultiQC, eliminación de lecturas del huésped, perfil taxonómico, análisis exploratorio y informes claros listos para investigación.
Recibirás salidas estructuradas adaptadas a tu proyecto, como archivos de metadatos limpios, informes QC, tablas resumen, figuras y notebooks o scripts reproducibles cuando estén incluidos en tu paquete.
Trabajo con archivos Excel/CSV/TSV y datos de secuenciación, usando Python, R, Linux, FastQC, MultiQC, fastp, KneadData, Bowtie2 y MetaPhlAn.
Por favor, proporciona solo datos desidentificados. Este servicio está destinado a fines de investigación y educativos y no proporciona diagnóstico clínico ni interpretación médica.
Para conjuntos de datos grandes, flujos de trabajo personalizados o preguntas específicas de investigación, contáctame antes de ordenar para confirmar el alcance y los entregables.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Con qué datos puedes trabajar?
Puedo trabajar con archivos de metadatos de secuenciación y metadatos de Excel, CSV, TSV, FASTQ desidentificados. Por favor, contáctame primero para BAM, VCF u otros formatos.
¿Qué recibiré?
Dependiendo del paquete, puedes recibir metadatos limpios, informes QC FASTQ, resúmenes MultiQC, lecturas recortadas, tablas taxonómicas, figuras, informes y código reproducible.
¿Procesas archivos FASTQ paired-end?
Sí. Puedo realizar control de calidad y recorte conservador para datos de secuenciación paired-end o single-end. Comparte el número de archivos y el tamaño total comprimido antes de ordenar.
¿Puedes analizar datos del microbioma?
Sí. Apoyo flujos de trabajo de investigación del microbioma y metagenómica, incluyendo organización de metadatos, QC, preprocesamiento, perfil taxonómico y análisis exploratorio.
¿Proporcionas interpretación clínica o diagnóstico?
No. Este Gig es solo para fines de investigación y educativos. No proporciono diagnóstico clínico, recomendaciones de tratamiento ni interpretación médica.
¿Cómo comparto mis datos?
Por favor, proporciona solo archivos desidentificados. Para grandes conjuntos de datos de secuenciación, contáctame antes de ordenar para acordar un método seguro de transferencia y el alcance del proyecto.
¿Puedes trabajar con proyectos grandes o personalizados?
Sí. Grandes conjuntos de datos, diseños de estudio complejos y flujos de trabajo personalizados requieren una oferta personalizada. Envíame un mensaje con tu pregunta de investigación, tipos de archivos, número de muestras y tamaño total de archivos.
