Ofreceré capacitación en vivo por Zoom sobre simulación de dinámica molecular

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Tengo más de 15 años de experiencia en ciencias de la vida en Estados Unidos, Japón y Bangladesh. He publicado más de 30 artículos de investigación en revistas internacionales revisadas por pares de r...

Nivel 2

Ha cumplido con los criterios de alto rendimiento y tiene un historial comprobado de cumplimiento de las expectativas de los clientes.

Acerca de este Servicio

¿Quieres aprender simulación de dinámica molecular (MD) a través de sesiones de entrenamiento claras, prácticas y en vivo por Zoom?

Ofrezco orientación paso a paso adaptada para principiantes, estudiantes e investigadores que desean dominar los flujos de trabajo de MD usando GROMACS.


Paquetes

Básico: Simulación de MD de proteínas

Aprende el flujo de trabajo completo para simular una proteína en agua.

Flujo de trabajo completo en GROMACS

Configuración del sistema: proteína en agua, dimensiones de la caja hasta 10 × 10 × 10 nm

Herramientas de análisis esenciales:

RMSD, RMSF, radio de giro (Rg), enlaces de hidrógeno


Estándar: Simulación de MD de proteína-ligando

Incluye todo en Básico, más:

Preparar y simular un complejo proteína-ligando en agua

Flujo de trabajo para generación de topología del ligando

Análisis adicional relevante para estudios de unión


Premium: Simulación avanzada de MD

Incluye todo en Estándar, más:

Simulación de MD de proteína de membrana (construcción de membrana + inserción)

Opciones adicionales de análisis, como:

Distancia, SASA, agrupamiento, MSD, contactos, gráficos personalizados, etc.

Adecuado para proyectos complejos a nivel de publicación


Información importante

Por favor comparte tu archivo PDB de proteína o el ID de PDB antes de la sesión.


Se aplica precios personalizados para análisis de proteínas muy grandes o multímericas o complejos.

Propósito de la lección:

Ciencia de Datos

Edad del estudiante:

Adultos (18-65)

Tecnología de desarrollo:

Linux

Bash

Otros